Nghiên cứu khoa học là một nhiệm vụ trọng tâm, nhằm khẳng định tiềm lực khoa học  của một trường đại học. Nhận thức được tầm quan trọng này, khoa Công nghệ thông tin, trường Đại học Hoa Sen đã đưa ra nhiều giải pháp nhằm đẩy mạnh công tác nghiên cứu khoa học của giảng viên và sinh viên trong thời gian qua.

Kể từ khi chuyển lên đại học năm 2006, công tác nghiên cứu khoa học của nhà trường đã được chú trọng đầu tư cho sinh viên và giảng viên, cả về kinh phí và vật chất phòng thí nghiệm cũng như con người nhờ đó mà trong những năm gần đây nhiệm vụ nghiên cứu khoa học của giảng viên và sinh viên đã có những chuyển biến rõ rệt, công tác nghiên cứu khoa học được nâng lên một mức cao. Nghiên cứu khoa học đã trở thành việc nhiệm vụ tự giác của mỗi Bộ môn và giảng viên, cũng từ đó tạo ra cảm hứng trong sinh viên thực hiện nghiên cứu khoa học. Chất lượng kết quả nghiên cứu khoa học của sinh viên và giảng viên được nâng lên.     

Hàng năm nhà trường tổ chức hội thảo nghiên cứu khoa học của sinh viên nhằm tổng kết và kích lệ tinh thần nghiên cứu khoa học trong giảng viên và sinh viên trong các năm tiếp theo. Kết quả hàng năm khoa Công nghệ thông tin đã có hàng chục đề tài của sinh viên báo cáo tại hội thảo nghiên cứu khoa học. Có nhiều sinh viên đạt giải thưởng sinh viên nghiên cứu khoa học của nhà trường. Các giảng viên cũng thực hiện đề tài cấp trường và tham gia các đề tài nghiên cứu khoa học Nafosted cấp nhà nước. Ngoài ra hàng năm giảng viên khoa Công nghệ thông tin cũng đã công bố nhiều bài báo khoa học có giá trị trên tạp chí khoa học quốc tế, tạp chí khoa học chuyên ngành trong nước.

Ngoài ra, nhằm nâng cao chất lượng nghiên cứu khoa học và tạo ra phong trào nghiên cứu trong giảng viên, năm 2016 khoa Công nghệ thông tin đã kết hợp với các trường đại học ở Đài Loan tổ chức hội nghị khoa học và công nghệ toàn quốc và quốc tế. Hội nghị khoa học được tổ chức thành công, đã có được nhiều nhà khoa học trong và ngoài nước cùng tham gia. Với mục tiêu hoạt động nghiên cứu khoa học gắn quá trình đào tạo với sự phát triển kinh tế xã hội, đồng thời gắn những kết quả nghiên cứu với giải quyết các nhiệm vụ thực tiễn. Trong năm 2015-2016, đã có những kết quả nghiên cứu khoa học của sinh viên thật sự khởi sắc, một số sinh viên tham gia báo cáo kết quả nghiên cứu tại hội nghị khoa học và diễn đàn khoa học toàn quốc do Bộ khoa học và Công nghệ tổ chức, kết quả nghiên cứu đã được xã hội đánh giá rất cao về khả năng nghiên cứu khoa học của sinh viên trường Đại học Hoa Sen.  

Trong thời gian tới khoa Công nghệ thông tin sẽ tiếp tục xây dựng phương hướng nghiên cứu khoa học theo hướng: thực hiện đẩy mạnh hơn nữa hoạt động nghiên cứu khoa học trong sinh viên nhằm nâng cao chất lượng đào tạo gắn liền với thực tế tại doanh nghiệp; điều này cũng sẽ giúp nâng cao học thuật của các giảng viên; sinh viên sẽ có nhiều cơ hội việc làm ngay sau khi ra trường; thời gian tới sẽ thường xuyên tổ chức các buổi hội thảo, diễn đàn, trao đổi về nghiên cứu khoa học cho giảng viên và sinh viên. Đồng thời tạo cơ chế mở rộng hoạt động hợp tác nghiên cứu khoa học với các đối tác tại trường đại học, viện nghiên cứu trong và ngoài nước.